FreeBSDで使用可能な最新のJDKは5.0です。インストールする方法は以下の２つがあります。
・Sun公開版JDKを使用する(Linuxバイナリ互換機能が必要)
・FreeBSD公開版JDK（Diablo）を使用する
ライセンスの問題、安定度、インストール時のコストの全てにおいて後者を使用するのが
望ましいようです。ちなみに前者の方法だとインストールに半日かかりました。

まずはmakeするのに必要な作業を調べます。
# cd /usr/ports/java/diablo-jdk15
# make fetch

すると、
 http://www.freebsdfoundation.org/downloads/java.shtmlから必要なファイル
をダウンロードし、それを/usr/ports/distfilesにコピーするように。
との指示がでるので、そのとおりに作業します。
# cp diablo-caffe-freebsd6-i386-1.5.0_07-b01.tar.bz2 /usr/ports/distfiles

いよいよmakeします。
# cd /usr/ports/java/diablo-jdk15/
# make install clean

正常にインストールされたか確認します。
# java -version
java version "1.5.0"
Java(TM) 2 Runtime Environment, Standard Edition (build diablo-1.5.0-b01)
Java HotSpot(TM) Client VM (build diablo-1.5.0_07-b01 , mixed mode)

これで完了です。

http://www.freebsdfoundation.org/press/によれば、FreeBSD Foundationは
現在JDK6のリリース作業に着手しているようです。

そういえばDiabloという名を聞くと往年の名作MMORPGを思い出しますね。
Daemon君みたいにかわいくはありません。本当の悪魔です。